Résistance bactérienne aux antibiotiques, apport du système national des données de santé - Inserm - Institut national de la santé et de la recherche médicale Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2020

Bacterial resistance to antibiotics, contribution of the national health data system

Résistance bactérienne aux antibiotiques, apport du système national des données de santé

Résumé

The massive use of antibiotics in human and veterinary medicine has led to a significant increase of bacterial resistance to these drugs, making infections more difficult to treat. Antimicrobial resistance has become a major public health issue, which is why many action plan have been implemented at national and global scales. This thesis aims to analyze and measure the epidemiological and public health impacts of bacterial resistance to antibiotics based on the French national medico-administrative databases of health insurance (SNDS). First, an assessment of antimicrobial resistance in France was carried out. It was estimated that resistant bacteria caused 139 105 (95% CI 127 920–150 289) infections in 2016, resulting in a 12.3% (95% CI 11.3–13.2) resistance rate, and 2.52 hospitalizations for 1 000 patient-days. Then, risk factors for the acquisition resistant organisms were examined in the context of hospitalized urinary tract infections. A matched case-control analysis was conducted. This study point out the critical window of 3 months before the hospitalization of interest, the impact of broad-spectrum antibiotic consumption, urological procedures (of which prostate biopsy) and long intensive care unit stays on antibiotic resistance. Finally, the repercussion of antibiotic resistance were studied, by comparing the care pathways that follow bone and joint infections on prosthesis. A sequence analysis was conducted on a matched exposed-non exposed sample, and 6 typical care pathways were provided. Then, the use of a multinomial logistic regression allowed to compare the effect of resistance on care pathways.
L'usage non maîtrisé des antibiotiques au cours des dernières années en médecine humaine et animale a conduit à une augmentation importante des résistances bactériennes à ces médicaments, rendant les infections plus difficiles à traiter. L'antibiorésistance est devenue aujourd'hui un enjeu de santé publique majeur, c'est pourquoi de nombreux plans d'action ont été mis en place, à l'échelle nationale et mondiale. Cette thèse a pour objectif d'analyser et de mesurer l'impact épidémiologique et de santé publique de la résistance bactérienne aux antibiotiques en s'appuyant sur les bases de données médico-administratives gérées par l'assurance maladie (SNDS). En premier lieu, une évaluation du poids de l'antibiorésistance à l’hôpital en France a été effectuée. Il a été estimé qu’en 2016, 140 000 infections à l’hôpital étaient dues à une bactérie résistante aux antibiotiques, soit 2,52 hospitalisations pour 1 000 jours-patients. Par la suite, les facteurs de risque de présenter une infection à bactérie résistante ont été recherchés, dans le cadre des infections urinaires hospitalisées. Une analyse cas-témoins appariée a été effectuée. Les trois mois précédant l’hospitalisation sont ressortis comme déterminants sur l’acquisition d’une infection résistante, avec comme exposition à risque : la consommation d’antibiotiques à large spectre, les actes invasifs sur les voies urinaires (notamment la biopsie de la prostate), et les séjours prolongés en unité de soins intensifs. Enfin, les retentissements de la résistance à court et long termes ont été étudiés, à travers les parcours de soins des patients ayant eu une infection ostéo-articulaire sur prothèse. Une analyse de séquence a été effectuée, sur un échantillon exposé-non exposé apparié, et a conduit à 6 parcours types. Une analyse multinomiale a permis de comparer l’impact de la résistance sur ces parcours de soins.
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Origine : Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-03149679 , version 1 (23-02-2021)

Identifiants

  • HAL Id : tel-03149679 , version 1

Citer

Marion Opatowski. Résistance bactérienne aux antibiotiques, apport du système national des données de santé. Médecine humaine et pathologie. Université Paris-Saclay, 2020. Français. ⟨NNT : 2020UPASR006⟩. ⟨tel-03149679⟩
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