Interoperability with Boutiques and CARMIN

Sorina Camarasu-Pop; Axel Bonnet; Camille Maumet; Michael Kain; Christian Barillot; Tristan Glatard

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Interoperability with Boutiques and CARMIN

Sorina Camarasu-Pop ^{1, 2} Axel Bonnet ³ Camille Maumet ⁴ Michael Kain ⁴ Christian Barillot ⁴ Tristan Glatard ⁵

1 Service Informatique et développements

CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé

2 Images et Modèles

CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé

3 CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé

4 VisAGeS - Vision, Action et Gestion d'informations en Santé

INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1228, Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA_D5 - SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE

5 Department of Computer-Science and Software Engineering [Montreal]

Sorina Camarasu-Pop ^{1, 2} AuthorId : 671822

Author IdHAL : camarasu ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7923-5069

Axel Bonnet ³ AuthorId : 11223055

Author IdHAL : axel-bonnet

Camille Maumet ⁴ AuthorId : 471453

Author IdHAL : cmaumet

Michael Kain ⁴ AuthorId : 1261945
Author

Christian Barillot ⁴ AuthorId : 52582

Author Employer institution : Centre National de la Recherche Scientifique IdHAL : cbarillot ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1589-7696

Tristan Glatard ⁵ AuthorId : 469087

Author

1 Service Informatique et développements (France) StructId : 530917

CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France) StructId : 139739
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France) StructId : 300284
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France) StructId : 300074
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein, 69621 Villeurbanne cedex - France) StructId : 219748
  - Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
  - INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France) StructId : 194495
  - Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France) StructId : 441569
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623

2 Images et Modèles (France) StructId : 396022

CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France) StructId : 139739
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France) StructId : 300284
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France) StructId : 300074
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein, 69621 Villeurbanne cedex - France) StructId : 219748
  - Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
  - INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France) StructId : 194495
  - Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France) StructId : 441569
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623

3 CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France) StructId : 139739

UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France) StructId : 300284
HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France) StructId : 300074
INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein, 69621 Villeurbanne cedex - France) StructId : 219748
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France) StructId : 194495
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France) StructId : 301088
CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France) StructId : 441569
INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623

4 VisAGeS - Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (Irisa, Campus de Beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 491318

INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1228 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France) StructId : 303623
Inria Rennes – Bretagne Atlantique (Campus de beaulieu 35042 Rennes cedex - France) StructId : 419153
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
IRISA_D5 - SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (France) StructId : 491232
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc Campus de Beaulieu 35042 RENNES CEDEX - France) StructId : 490899
  - UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France) StructId : 105160
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - INSA Rennes - Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (20, avenue des Buttes de Coësmes - CS 70839 - 35708 Rennes cedex 7 - France) StructId : 117606
    - INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France) StructId : 301232
    - UNIV-RENNES - Université de Rennes (France) StructId : 528860
  - UBS - Université de Bretagne Sud (BP 92116 - 56321 Lorient cedex - France) StructId : 172265
  - ENS Rennes - École normale supérieure - Rennes (Campus de Ker Lann - avenue Robert Schuman - 35170 Bruz - France) StructId : 247362
  - Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France) StructId : 300009
  - CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France) StructId : 411575
  - CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6074 (France) StructId : 441569
  - IMT Atlantique - IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire (Campus Brest : Technopôle Brest-Iroise CS 8381829238 BREST Cedex 3 - Campus Nantes : 4, rue Alfred Kastler- La chantrerie 44300 NANTES - Campus Rennes : 2 Rue de la Châtaigneraie, 35510 CESSON SEVIGNE - France) StructId : 481355

5 Department of Computer-Science and Software Engineering [Montreal] (1515 Ste-Catherine St. W. Montreal, Quebec H3G 1M8 - Canada) StructId : 539899

Concordia University [Montreal] (1455 Boulevard de Maisonneuve O, Montréal, QC H3G 1M8 - Canada) StructId : 355894

Abstract : A growing number of platforms and tools have lately been developed to meet the needs of various scientific communities. Most of these solutions are optimized to specific requirements from different user groups, leading to technological fragmentation and lack of interoperability. In our quest of open and reproducible science, we propose two complementary tools, Boutiques and CARMIN, providing cross-platform interoperability for scientific applications, data sharing and processing.

Document type :

Conference papers

Domain :

Life Sciences [q-bio] / Neurons and Cognition [q-bio.NC]

Liste complète des métadonnées

https://www.hal.inserm.fr/inserm-01846997
Contributor : Camille Maumet <>
Submitted on : Monday, July 23, 2018 - 10:14:06 AM
Last modification on : Monday, March 4, 2019 - 2:07:43 PM
Document(s) archivé(s) le : Wednesday, October 24, 2018 - 1:03:49 PM

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DI4R 2018 - Interoperability w...

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HAL Id : inserm-01846997, version 1

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Citation

Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Camille Maumet, Michael Kain, Christian Barillot, et al.. Interoperability with Boutiques and CARMIN. DI4R 2018 - Digital Infrastructures for Research, Oct 2018, Lisbon, Portugal. pp.1. ⟨inserm-01846997⟩

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