 |
A virtual imaging platform for multi-modality medical image simulation.
Tristan Glatard
1, *
Carole Lartizien
1
Bernard Gibaud
2
Rafael Ferreira da Silva
1
Germain Forestier
3, 2
Frederic Cervenansky
4
Martino Alessandrini
5
Hugues Benoit-Cattin
1
Olivier Bernard
1
Sorina Camarasu-Pop
4, 1
Nadia Cerezo
6
Patrick Clarysse
7
Alban Gaignard
6
Patrick Hugonnard
8
Hervé Liebgott
5
Simon Marache-Francisco
9
Adrien Marion
9
Johan Montagnat
6
Joachim Tabary
8
Denis Friboulet
1
*
Corresponding author
1
Images et Modèles
CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé
4
Service Informatique et développements
CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé
5
Imagerie Ultrasonore
CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé
6
Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe MODALIS
Laboratoire I3S - SPARKS - Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems
7
MOTIVATE - Imagerie et modélisation Vasculaires, Thoraciques et Cérébrales
CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé : 139739
Tristan Glatard 1
Mail :
Correspondent author
Carole Lartizien 1
Mail :
Author IdHAL : carole-lartizien ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/H-4447-2014 ORCID : https://orcid.org/0000-0001-7594-4231
Bernard Gibaud 2
Author
Rafael Ferreira da Silva 1
Author
Germain Forestier 3, 2
Mail :
Author IdHAL : germain-forestier ORCID : https://orcid.org/0000-0002-4960-7554
Frederic Cervenansky 4
Mail :
Author IdHAL : frederic-cervenansky
Martino Alessandrini 5
Author
Hugues Benoit-Cattin 1
Mail :
Author IdHAL : hugues-benoit-cattin ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/H-4094-2014
Olivier Bernard 1
Mail : Site :
Author IdHAL : bernard-creatis
Sorina Camarasu-Pop 4, 1
Mail :
Author IdHAL : camarasu ORCID : https://orcid.org/0000-0002-7923-5069
Nadia Cerezo 6
Mail : Site :
Author
Patrick Clarysse 7
Mail :
Author IdHAL : patrick-clarysse ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/G-6371-2014 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5495-7655
Alban Gaignard 6
Mail : Site :
Author IdHAL : alban-gaignard ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/D-1333-2018 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3597-8557
Patrick Hugonnard 8
Author
Hervé Liebgott 5
Mail :
Author IdHAL : herve-liebgott
Simon Marache-Francisco 9
Author
Adrien Marion 9
Mail :
Author
Johan Montagnat 6
Mail :
Author IdHAL : johan-montagnat
Joachim Tabary 8
Author
Denis Friboulet 1
Mail :
Author IdHAL : denisfriboulet ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/A-1804-2012 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-9166-7964
1
Images et Modèles (France)
- CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France)
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France)
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France)
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein,
69621 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
2
LTSI - Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (Campus Universitaire de Beaulieu - Bât 22 - 35042 Rennes - France)
- UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France)
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1099 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
3
MIPS - Modélisation, Intelligence, Processus et Système (ENSISA 12, rue des frères Lumière 68093 - MULHOUSE CEDEX - France)
- Université de Haute-Alsace (UHA) - Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (2, rue des Frères Lumière F-68093 Mulhouse Cedex - France)
- Ecole Nationale Supérieure d'Ingénieur Sud Alsace (France)
4
Service Informatique et développements (France)
- CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France)
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France)
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France)
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein,
69621 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
5
Imagerie Ultrasonore (France)
- CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France)
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France)
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France)
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein,
69621 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
6
Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe MODALIS (France)
- Laboratoire I3S - SPARKS - Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems (Laboratoire I3S
CS 40121
06903 Sophia Antipolis Cedex - France)
- I3S - Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (2000, route des Lucioles - Les Algorithmes - bât. Euclide B 06900 Sophia Antipolis - France)
- UNS - Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (Parc Valrose - BP 2135 - 06103 Nice cedex 2 - France)
- UCA - Université Côte d'Azur (Parc Valrose, 28 avenue Valrose 06108 Nice Cedex 2 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7271 (France)
- UNS - Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (Parc Valrose - BP 2135 - 06103 Nice cedex 2 - France)
- I3S - Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (2000, route des Lucioles - Les Algorithmes - bât. Euclide B 06900 Sophia Antipolis - France)
7
MOTIVATE - Imagerie et modélisation Vasculaires, Thoraciques et Cérébrales (France)
- CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé : 139739 (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France)
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France)
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France)
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein,
69621 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
8
CEA-LETI - Centre d'études nucléaires - Laboratoire d'Electronique et de Technologie de l'Information (MINATEC 17, rue des Martyrs, 38054, Grenoble Cedex 9 - France)
- DRT (CEA) - Direction de Recherche Technologique (CEA) : DRT (France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DRT (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- UGA - Université Grenoble Alpes (CS 40700 - 38058 Grenoble cedex - France)
9
CREATIS - Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (7 avenue Jean Capelle, Bat Blaise Pascal, 69621 Villeurbanne Cedex - France)
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France)
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France)
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein,
69621 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5220 (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1206 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
Abstract : This paper presents the Virtual Imaging Platform (VIP), a platform accessible at http://vip.creatis.insa-lyon.fr to facilitate the sharing of object models and medical image simulators, and to provide access to distributed computing and storage resources. A complete overview is presented, describing the ontologies designed to share models in a common repository, the workflow template used to integrate simulators, and the tools and strategies used to exploit computing and storage resources. Simulation results obtained in four image modalities and with different models show that VIP is versatile and robust enough to support large simulations. The platform currently has 200 registered users who consumed 33 years of CPU time in 2011.
Document type :
Journal articles
Domain :
Complete list of metadatas
https://www.hal.inserm.fr/inserm-00762497
Contributor : Ltsi Equipe Medicis <>
Submitted on : Friday, December 7, 2012 - 11:00:48 AM
Last modification on : Monday, March 30, 2020 - 12:48:03 PM
Document(s) archivé(s) le : Saturday, December 17, 2016 - 10:21:16 PM
Contributor : Ltsi Equipe Medicis <>
Submitted on : Friday, December 7, 2012 - 11:00:48 AM
Last modification on : Monday, March 30, 2020 - 12:48:03 PM
Document(s) archivé(s) le : Saturday, December 17, 2016 - 10:21:16 PM
File
06310064.pdf
Files produced by the author(s)
Identifiers
- HAL Id : inserm-00762497, version 1
- PUBMED : 23014715
- DOI : 10.1109/TMI.2012.2220154
Collections
CEA | HCL | CNRS | UNIV-RENNES1 | I3S | CREATIS | LTSI | PRIMES | PRIMES_WP5 | UNICE | SCD-UHA | DRT | INSA-LYON | UNIV-COTEDAZUR | UNIV-LYON1 | UNIV-ST-ETIENNE | LETI | SITE-ALSACE | UNIV-RENNES | INSA-GROUPE | CEA-GRE | UDL
Citation
Tristan Glatard, Carole Lartizien, Bernard Gibaud, Rafael Ferreira da Silva, Germain Forestier, et al.. A virtual imaging platform for multi-modality medical image simulation.. IEEE Transactions on Medical Imaging, Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2013, 32 (1), pp.110-8. ⟨10.1109/TMI.2012.2220154⟩. ⟨inserm-00762497⟩
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