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Journal articles
Integrative study of pandemic A/H1N1 influenza infections: design and methods of the CoPanFlu-France cohort.
Nathanael Lapidus
1, *
Xavier de Lamballerie
2, 3, 4
Nicolas Salez
2
Michel Setbon
4
Pascal Ferrari
1
Rosemary Delabre
1
Marie-Lise Gougeon
5
Frédéric Vely
6
Marianne Leruez-Ville
7, 8
Laurent Andreoletti
9
Simon Cauchemez
10
Pierre-Yves Boëlle
1, 11
Eric Vivier
Laurent Abel
7, 12
Michaël Schwarzinger
13
Michèle Legeas
4
Pierre Le Cann
4
Antoine Flahault
1, 4, 14
Fabrice Carrat
1, 11
*
Corresponding author
Nathanael Lapidus 1
Correspondent author IdHAL : nathanael-lapidus ORCID : https://orcid.org/0000-0002-4837-1068
Xavier de Lamballerie 2, 3, 4
Author
Nicolas Salez 2
Author
Michel Setbon 4
Author
Pascal Ferrari 1
Author
Rosemary Delabre 1
Author
Marie-Lise Gougeon 5
Author
Frédéric Vely 6
Author
Marianne Leruez-Ville 7, 8
Author
Laurent Andreoletti 9
Author
Simon Cauchemez 10
Author
Pierre-Yves Boëlle 1, 11
Author IdHAL : pierre-yves-boelle ORCID : https://orcid.org/0000-0002-5367-8232
Eric Vivier
Author IdHAL : eric-vivier ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/F-8939-2010
Laurent Abel 7, 12
Author
Michaël Schwarzinger 13
Author
Michèle Legeas 4
Author
Pierre Le Cann 4
Author Employer institution : École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] IdHAL : pierre-le-cann
Antoine Flahault 1, 4, 14
Author
Fabrice Carrat 1, 11
Author IdHAL : fabrice-carrat ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/P-6177-2017 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-8672-7918
1
ESIM - Epidémiologie des maladies infectieuses et modélisation (Faculte de Médecine Saint-Antoine 27, Rue Chaligny 75571 Paris Cedex 12 - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U707 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
2
EPV - Emergence des Pathologies Virales (Faculté de médecine
27 Bd jean Moulin
13385 Marseille Cedex 5 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : UMR_D 190 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement : UMR_D 190 (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UMR_D 190 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- APHM - Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille : UMR_D 190 (Direction générale AP-HM 80, rue Brochier 13 354 Marseille Cedex 5 - France)
3
Laboratoire de Virologie (80, rue Brochier 13354 Marseille - France)
- APHM - Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (Direction générale AP-HM 80, rue Brochier 13 354 Marseille Cedex 5 - France)
- Pôle hospitalier de Microbiologie et Maladies Infectieuses (France)
4
EHESP - École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (15, avenue du Pr. Léon Bernard - 35043 Rennes Cedex - France)
5
IABV - Immunité Anti-virale, Biothérapie et Vaccins (Département Infection et Epidémiologie, 25 rue du Dr Roux 75725 Paris cedex 15 - France)
- Institut Pasteur [Paris] (25-28, rue du docteur Roux, 75724 Paris cedex 15 - France)
6
CIML - Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy (Parc scientifique et technologique de Luminy - 163, avenue de Luminy - Case 906 - 13288 Marseille cedex 09 - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UM 2 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : UMR_S 1104 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7280 (France)
7
Infections à Vih, Réservoirs, Pharmacologie des Antirétroviraux et Prévention de la Transmission Mère Enfant (Site Necker-Enfants Malades 149 rue de Sèvres - 75743 PARIS cedex 15 et 156 rue de Vaugirard - 75730 PARIS cedex 15 - France)
- UPD5 - Université Paris Descartes - Paris 5 : EA3620 (12, rue de l'École de Médecine - 75270 Paris cedex 06 - France)
8
Laboratoire de Virologie (Laboratoire de Virologie, Hôpital Necker, AP-HP, Paris, France - France)
- CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP] (149 Rue de Sèvres 75015 Paris - France)
9
CardioVir - Laboratoire de Virologie Médicale et Moléculaire - EA 4684 (Laboratoire de Virologie Médicale et Moléculaire
Université de Reims Champagne-Ardenne
Faculté de médecine
51 Avenue Cognac Jay
51092 Reims Cedex France - France)
- URCA - Université de Reims Champagne-Ardenne : EA 4684 (2 avenue Robert Schuman, 51100 Reims. - France)
- SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé) (Faculté de Médecine de Reims, 51, rue Cognacq Jay, CS 30018,
51095 Reims Cedex - France)
- URCA - Université de Reims Champagne-Ardenne : FED 4231 (2 avenue Robert Schuman, 51100 Reims. - France)
- UPJV - Université de Picardie Jules Verne : FED 4231 (Chemin du Thil - 80000 Amiens - France)
- CHU Reims - Centre Hospitalier Universitaire de Reims (45, rue Cognacq-Jay 51100 Reims - France)
10
Medical Research Council Centre for Outbreak Analysis and Modeling (South Kensington Campus, London SW7 2AZ - United Kingdom)
- Imperial College London (South Kensington Campus, London SW7 2AZ - United Kingdom)
- Department of Infectious Disease Epidemiology (France)
11
CHU Saint-Antoine [AP-HP] (184, rue du Faubourg Saint-Antoine
75571 Paris cedex 12 - France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- Sorbonne Université (France)
12
Laboratory of Human Genetics of Infectious Diseases (1230 York Avenue, New York, NY 10065 - United States)
- Rockefeller Branch (France)
- Rockefeller University [New York] (1230 York Ave, New York, NY 10065, États-Unis - United States)
13
SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD - Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (Faculté de Médecine - Site Timone - 27 Bd Jean Moulin 13385 – Marseille Cedex 05 - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U912 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- AMU - Aix Marseille Université (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
14
LEST - Laboratoire d'économie et de sociologie du travail (35 Avenue Jules Ferry - 13626 Aix en Provence cedex 1 - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UMR7317 / UMR6123 / UPR9059 / ERS99 / UPR7511 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7317 / UMR6123 / UPR9059 / ERS99 / UPR7511 (France)
Abstract : ABSTRACT: BACKGROUND: The risk of influenza infection depends on biological characteristics, individual or collective behaviors and the environmental context. The Cohorts for Pandemic Influenza (CoPanFlu) France study was set up in 2009 after the identification of the novel swine-origin A/H1N1 pandemic influenza virus. This cohort of 601 households (1450 subjects) representative for the general population aims at using an integrative approach to study the risk and characteristics of influenza infection as a complex combination of data collected from questionnaires regarding sociodemographic, medical, behavioral characteristics of subjects and indoor environment, biological samples or environmental databases. METHODS: Households were included between December 2009 and July 2010. The design of this study relies on systematic follow-up visits between influenza seasons and additional visits during influenza seasons, when an influenza-like illness is detected in a household via an active surveillance system. During systematic visits, a nurse collects individual and environmental data on questionnaires and obtains blood samples from all members of the household. When an influenza-like-illness is detected, a nurse visits the household three times during the 12 following days, and collects data on questionnaires regarding exposure and symptoms, and biological samples (including nasal swabs) from all subjects in the household. The end of the follow-up period is expected in fall 2012. DISCUSSION: The large amount of data collected throughout the follow-up will permit a multidisciplinary study of influenza infections. Additional data is being collected and analyzed in this ongoing cohort. The longitudinal analysis of these households will permit integrative analyses of complex phenomena such as individual, collective and environmental risk factors of infection, routes of transmission, or determinants of the immune response to infection or vaccination.
Document type :
Journal articles
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https://www.hal.inserm.fr/inserm-00730688
Contributor : Ed. Bmc <>
Submitted on : Monday, September 10, 2012 - 9:07:33 PM
Last modification on : Thursday, May 27, 2021 - 5:08:03 PM
Long-term archiving on: : Tuesday, December 11, 2012 - 3:43:34 AM
Contributor : Ed. Bmc <>
Submitted on : Monday, September 10, 2012 - 9:07:33 PM
Last modification on : Thursday, May 27, 2021 - 5:08:03 PM
Long-term archiving on: : Tuesday, December 11, 2012 - 3:43:34 AM
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1471-2458-12-417.pdf
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Identifiers
- HAL Id : inserm-00730688, version 1
- DOI : 10.1186/1471-2458-12-417
- PUBMED : 22676272
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INSERM | CNRS | PASTEUR | UPMC | UNIV-AMU | UNIV-PARIS5 | IRSET-LERES | IRSET | BIOSIT | COPANFLU | UR1-UFR-SVE | EHESP | USPC | IRD | URCA | CARDIOVIR | CAPSANTE | CERCLE | U1252 | SORBONNE-UNIVERSITE | DSETGS | IRSET-EHESP | UNIV-PARIS | SU-TI
Citation
Nathanael Lapidus, Xavier de Lamballerie, Nicolas Salez, Michel Setbon, Pascal Ferrari, et al.. Integrative study of pandemic A/H1N1 influenza infections: design and methods of the CoPanFlu-France cohort.. BMC Public Health, BioMed Central, 2012, 12 (1), pp.417. ⟨10.1186/1471-2458-12-417⟩. ⟨inserm-00730688⟩
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