Genome-wide profiling of G protein-coupled receptors in cerebellar granule neurons using high-throughput, real-time PCR. - Inserm - Institut national de la santé et de la recherche médicale Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue BMC Genomics Année : 2011

Genome-wide profiling of G protein-coupled receptors in cerebellar granule neurons using high-throughput, real-time PCR.

Résumé

ABSTRACT: BACKGROUND: G protein-coupled receptors (GPCRs) are major players in cell communication, regulate a whole range of physiological functions during development and throughout adult life, are affected in numerous pathological situations, and constitute so far the largest class of drugable targets for human diseases. The corresponding genes are usually expressed at low levels, making accurate, genome-wide quantification of their expression levels a challenging task using microarrays. RESULTS: We first draw an inventory of all endo-GPCRs encoded in the murine genome. To profile GPCRs genome-wide accurately, sensitively, comprehensively, and cost-effectively, we designed and validated a collection of primers that we used in quantitative RT-PCR experiments. We experimentally validated a statistical approach to analyze genome-wide, real-time PCR data. To illustrate the usefulness of this approach, we determined the repertoire of GPCRs expressed in cerebellar granule neurons and neuroblasts during postnatal development. CONCLUSIONS: We identified tens of GPCRs that were not detected previously in this cell type; these GPCRs represent novel candidate players in the development and survival of cerebellar granule neurons. The sequences of primers used in this study are freely available to those interested in quantifying GPCR expression comprehensively.

Domaines

Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]
Fichier principal
Vignette du fichier
1471-2164-12-241.pdf (388.03 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S1.XLS (337.5 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S10.PDF (29.1 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S11.PDF (37.25 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S12.PDF (33.22 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S13.PDF (35.88 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S14.XLS (73 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S15.XLS (210.5 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S2.XLS (11 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S3.XLS (98 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S4.XLS (12 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S5.PDF (28.75 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S6.PDF (29.02 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S7.PDF (29.24 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S8.PDF (29.6 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241-S9.PDF (34.75 Ko) Télécharger le fichier
1471-2164-12-241.xml (64.77 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre
Format : Autre

Ed. BMC  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://inserm.hal.science/inserm-00599324

Soumis le : jeudi 9 juin 2011-14:05:45

Dernière modification le : mardi 5 mars 2024-11:14:40

Archivage à long terme le : vendredi 9 novembre 2012-14:56:05

Télécharger pour visualiser

Dates et versions

inserm-00599324 , version 1 (09-06-2011)

Identifiants

Citer

Benjamin Maurel, Anne Le Digarcher, Christelle Dantec, Laurent Journot. Genome-wide profiling of G protein-coupled receptors in cerebellar granule neurons using high-throughput, real-time PCR.. BMC Genomics, 2011, 12 (1), pp.241. ⟨10.1186/1471-2164-12-241⟩. ⟨inserm-00599324⟩

Exporter

BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite

Collections

INSERM CNRS IGF BS UNIV-MONTPELLIER
199 Consultations
328 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More