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Conference papers
Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.
Franck Michel
1, *
Alban Gaignard
2
Farooq Ahmad
1
Christian Barillot
1
Bénédicte Batrancourt
3, 4
Michel Dojat
5
Bernard Gibaud
1
Pascal Girard
5, 6
David Godard
7
Gilles Kassel
8
Diane Lingrand
2
Grégoire Malandain
6
Johan Montagnat
2
Mélanie Pélégrini-Issac
4, 9
Xavier Pennec
6
Javier Rojas Balderrama
2
Bacem Wali
2
*
Corresponding author
1
VisAGeS - Vision, Action et Gestion d'informations en Santé
INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U746, Inria Rennes – Bretagne Atlantique , IRISA-D5 - SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE
2
Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe MODALIS
Laboratoire I3S - SPARKS - Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems
6
ASCLEPIOS - Analysis and Simulation of Biomedical Images
CRISAM - Inria Sophia Antipolis - Méditerranée
Franck Michel 1
Correspondent author IdHAL : fmichel ORCID : https://orcid.org/0000-0001-9064-0463
Alban Gaignard 2
Author IdHAL : alban-gaignard ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/D-1333-2018 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3597-8557
Farooq Ahmad 1
Author
Christian Barillot 1
Author IdHAL : cbarillot ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1589-7696
Bénédicte Batrancourt 3, 4
Author
Michel Dojat 5
Author IdHAL : michel-dojat ORCID : https://orcid.org/0000-0003-2747-6845
Bernard Gibaud 1
Author
Pascal Girard 5, 6
Author
David Godard 7
Author
Gilles Kassel 8
Author
Diane Lingrand 2
Author IdHAL : diane-lingrand ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3509-7397
Grégoire Malandain 6
Author Employer institution : Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique IdHAL : gregoire-malandain ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/ J-8115-2015 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-4559-1575
Johan Montagnat 2
Author IdHAL : johan-montagnat
Mélanie Pélégrini-Issac 4, 9
Author
Xavier Pennec 6
Author IdHAL : xavier-pennec ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/L-2537-2013 ORCID : https://orcid.org/0000-0002-6617-7664
Javier Rojas Balderrama 2
Author IdHAL : jrbalderrama ORCID : https://orcid.org/0000-0002-3341-2525
Bacem Wali 2
Author
1
VisAGeS - Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (IRISA, campus de Beaulieu F-35042 Rennes - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U746 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- Inria Rennes – Bretagne Atlantique (Campus de beaulieu
35042 Rennes cedex - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- IRISA-D5 - SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (France)
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc
Campus de Beaulieu
35042 RENNES CEDEX - France)
- INSA Rennes - Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (20, avenue des Buttes de Coësmes - CS 70839 - 35708 Rennes cedex 7 - France)
- UBS - Université de Bretagne Sud (BP 92116 - 56321 Lorient cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6074 (France)
- ENS Rennes - École normale supérieure - Rennes (Campus de Ker Lann - avenue Robert Schuman - 35170 Bruz - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
- Télécom Bretagne (Technopôle Brest-Iroise CS 83818 29238 BREST Cedex 3 - France)
- UR1 - Université de Rennes 1 (2 rue du Thabor - CS 46510 - 35065 Rennes cedex - France)
- UNIV-RENNES - Université de Rennes (France)
- CentraleSupélec (3, rue Joliot Curie, Plateau de Moulon, 91192 GIF-SUR-YVETTE Cedex - France)
- IRISA - Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (Avenue du général Leclerc
Campus de Beaulieu
35042 RENNES CEDEX - France)
2
Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe MODALIS (France)
- Laboratoire I3S - SPARKS - Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems (Laboratoire I3S
CS 40121
06903 Sophia Antipolis Cedex - France)
- I3S - Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (2000, route des Lucioles - Les Algorithmes - bât. Euclide B 06900 Sophia Antipolis - France)
- UNS - Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (Parc Valrose - BP 2135 - 06103 Nice cedex 2 - France)
- COMUE UCA - COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (Parc Valrose, 28 avenue Valrose 06108 Nice Cedex 2 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7271 (France)
- UCA - Université Côte d'Azur (Parc Valrose, 28 avenue Valrose 06108 Nice Cedex 2 - France)
- UNS - Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (Parc Valrose - BP 2135 - 06103 Nice cedex 2 - France)
- I3S - Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (2000, route des Lucioles - Les Algorithmes - bât. Euclide B 06900 Sophia Antipolis - France)
3
CRICM - Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (GH Pitié-Salpêtrière 47, boulevard de l'Hôpital 75651 Paris cedex 13 - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U975 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7225 (France)
4
IIN - Institut d'imagerie neurofonctionnelle (4 Place du général Leclerc 91401 ORSAY CEDEX - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : IFR49 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- ENST - Ecole Nationale Supérieure des Télécommunications (46 rue Barrault 75634 Paris Cedex 13 - France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DSV/I2BM (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- EHESS - École des hautes études en sciences sociales (54, boulevard Raspail 75006 Paris - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : IFR49 (France)
5
GIN - Grenoble Institut des Neurosciences (UJF - Site Santé La Tronche - BP 170 - 38042 Grenoble Cedex 9 - France)
- UJF - Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (BP 53 - 38041 Grenoble Cedex 9 - France)
- CHU Grenoble (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U836 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
6
ASCLEPIOS - Analysis and Simulation of Biomedical Images (2004 route des lucioles, BP93 06902 Sophia Antipolis Cedex - France)
- CRISAM - Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (2004 route des Lucioles BP 93 06902 Sophia Antipolis - France)
- Inria - Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Domaine de Voluceau Rocquencourt - BP 105 78153 Le Chesnay Cedex - France)
7
Visioscopie (Pépinière d'entreprise Nice Cote d'Azur Nice La Plaine 1 bat. F4 Avenue Pontremoli 06200 Nice - France)
- Visioscopie (France)
8
MIS - Modélisation, Information et Systèmes - UR UPJV 4290 (Université de Picardie Jules Verne - UFR des Sciences - 33, rue Saint Leu -
80039 AMIENS CEDEX 1 - France)
- UPJV - Université de Picardie Jules Verne : UR4290 (Chemin du Thil - 80000 Amiens - France)
9
LIF - Laboratoire d'Imagerie Fonctionnelle (Faculte de Medecine Pitie-Salpetriere 91, Boulevard de L'Hopital 75634 PARIS CEDEX 13 - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- IFR14 (France)
- IFR49 (France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U678 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
Abstract : Grid technologies are appealing to deal with the challenges raised by computational neurosciences and support multi-centric brain studies. However, core grids middleware hardly cope with the complex neuroimaging data representation and multi-layer data federation needs. Moreover, legacy neuroscience environments need to be preserved and cannot be simply superseded by grid services. This paper describes the NeuroLOG platform design and implementation, shedding light on its Data Management Layer. It addresses the integration of brain image files, associated relational metadata and neuroscience semantic data in a heterogeneous distributed environment, integrating legacy data managers through a mediation layer.
Document type :
Conference papers
Domain :
Complete list of metadata
https://www.hal.inserm.fr/inserm-00512799
Contributor : Aline Grosset <>
Submitted on : Tuesday, August 31, 2010 - 4:08:28 PM
Last modification on : Wednesday, May 5, 2021 - 9:38:03 AM
Long-term archiving on: : Wednesday, December 1, 2010 - 2:53:07 AM
Contributor : Aline Grosset <>
Submitted on : Tuesday, August 31, 2010 - 4:08:28 PM
Last modification on : Wednesday, May 5, 2021 - 9:38:03 AM
Long-term archiving on: : Wednesday, December 1, 2010 - 2:53:07 AM
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neurolog_healthgrid_2010.pdf
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- HAL Id : inserm-00512799, version 1
- DOI : 10.3233/978-1-60750-583-9-112
- PUBMED : 20543431
Collections
INSERM | CEA | CNRS | INRIA | UNIV-RENNES1 | I3S | IRISA | U836 | LIB | UPMC | ICM | UNICE | IRISA-D5 | EHESS | UR1-UFR-ISTIC | UNIV-COTEDAZUR | UNIV-RENNES | SORBONNE-UNIVERSITE | SU-MEDECINE | SU-SCIENCES | INSTITUT-TELECOM | INSA-RENNES | UGA | SU-TI | MIS
Citation
Franck Michel, Alban Gaignard, Farooq Ahmad, Christian Barillot, Bénédicte Batrancourt, et al.. Grid-wide neuroimaging data federation in the context of the NeuroLOG project.. HealthGrid'10, Jun 2010, Paris, France. pp.112-123, ⟨10.3233/978-1-60750-583-9-112⟩. ⟨inserm-00512799⟩
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