Clustering patterns of LOD scores for asthma-related phenotypes revealed by a genome-wide screen in 295 French EGEA families.

Emmanuelle Bouzigon; Marie-Hélène Dizier; Christine Krähenbühl; Arnaud Lemainque; Isabella Annesi-Maesano; Christine Betard; Jean Bousquet; Denis Charpin; Frédéric Gormand; Michel Guilloud-Bataille; Jocelyne Just; Nicole Le Moual; Jean Maccario; Régis Matran; Françoise Neukirch; Marie-Pierre Oryszczyn; Evelyne Paty; Isabelle Pin; Myriam Rosenberg-Bourgin; Daniel Vervloet; Francine Kauffmann; Mark Lathrop; Florence Demenais

hal-00595818, version 1

Clustering patterns of LOD scores for asthma-related phenotypes revealed by a genome-wide screen in 295 French EGEA families.
Bouzigon E., Dizier M.-H., Krähenbühl C., Lemainque A., Annesi-Maesano I., Betard C., Bousquet J., Charpin D., Gormand F., Guilloud-Bataille M. et al
Human Molecular Genetics 13, 24 (2004) 3103-13 - http://hal.upmc.fr/hal-00595818

Subject:

Life Sciences/Santé publique et épidémiologie

PMID (PubMed ID):

(15509591)

Title:

Clustering patterns of LOD scores for asthma-related phenotypes revealed by a genome-wide screen in 295 French EGEA families.

Author(s):

Emmanuelle Bouzigon^{1, 2}, Marie-Hélène Dizier^{1, 2, 3}, Christine Krähenbühl, Arnaud Lemainque⁴, Isabella Annesi-Maesano (

) ⁵, Christine Betard⁴, Jean Bousquet^{6, 7}, Denis Charpin⁸, Frédéric Gormand⁹, Michel Guilloud-Bataille^{6, 10}, Jocelyne Just¹¹, Nicole Le Moual⁶, Jean Maccario¹², Régis Matran¹³, Françoise Neukirch¹⁴, Marie-Pierre Oryszczyn⁶, Evelyne Paty¹⁵, Isabelle Pin^{16, 17}, Myriam Rosenberg-Bourgin, Daniel Vervloet¹⁸, Francine Kauffmann¹⁹, Mark Lathrop²⁰, Florence Demenais^{1, 2}, For the E Bouzigon , MH Dizier , C Krähenbühl , Lemainque A , Annesi-Maesano I , C Betard , Bousquet J , Charpin D , F Gormand , Guilloud-Bataille M , Just J , Le Moual N , Maccario J , R Matran , Neukirch F , MP Oryszczyn , E Paty , je Pin , M-Bourgin Rosenberg , Vervloet D , Kauffmann F , Lathrop M , F Demenais . collaboration(s)

Laboratory:

1:	CEPH - Centre d'Etude du Polymorphisme Humain

Institut Universitaire d'Hématologie – Fondation Jean Dausset – Université Paris VII - Paris Diderot

27, rue Juliette Dodu, 75010 Paris

France

2:	Variabilité Génétique et Maladies Humaines

Université Paris VII - Paris Diderot – INSERM : U946

Igm fondation Jean Dausset ceph 27 rue Juliette Dodu 4eme etage 75010 paris

France

3:	Institut Universitaire d'Hématologie

Université Paris VII - Paris Diderot

Paris

France

4:	CNG - Centre National de Génotypage

http://www.cng.fr

CEA : DSV/IG

Centre National de Génotypage 2 rue Gaston Crémieux CP5721 91057 EVRY Cedex

France

5:	ESIM - Epidémiologie des maladies infectieuses et modélisation

http://www.u707.jussieu.fr

INSERM : U707 – Université Pierre et Marie Curie [UPMC] - Paris VI

Faculte de Médecine Saint-Antoine 27, Rue Chaligny 75571 Paris Cedex 12

France

6:	Recherche en épidémiologie et biostatistique

INSERM : IFR69 – Université Paris XI - Paris Sud

16, Avenue Paul Vaillant-Couturier 94807 VILLEJUIF CEDEX

France

7:	Département pneumologie et addictologie [Montpellier]

Hôpital Arnaud de Villeneuve – CHRU Montpellier

371, av. du Doyen Gaston Giraud 34295 Montpellier cedex 5

France

8:	Service Pneumologie – Allergologie

AP-HM – Hôpital nord

France

9:	Service de pneumologie [Lyon]

http://www.chu-lyon.fr/web/1846

Hospices Civils de Lyon – Centre Hospitalier Lyon-Sud

Chemin du Grand Revoyet 69495 Pierre-Bénite

France

10:	Génétique épidémiologique et structures des populations humaines

INSERM : U535 – IFR69 – Université Paris XI - Paris Sud

Hopital Paul Brousse 94817 VILLEJUIF CEDEX

France

11:	Centre de l'asthme et de l'allergologie

Hôpital Armand Trousseau – Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)

26 avenue du docteur Arnold Netter 75012 Paris

France

12:	Faculté des sciences pharmaceutiques et biologiques

http://www.pharmacie.univ-paris5.fr/

Université Paris V - Paris Descartes

4 avenue de l'Observatoire 75270 Paris cedex 5

France

13:	Hôpital Albert Calmette

CHRU Lille – Université Lille II - Droit et santé

Bd du Pr Leclercq 59037 Lille

France

14:	Physiopathologie et Epidemiologie de l'Insuffisance Respiratoire

INSERM : U700 – Université Paris VII - Paris Diderot

Faculte de Medecine Xavier Bichat PARIS VII 16, Rue Henri Huchard 75870 PARIS CEDEX 18

France

15:	Service de Pneumologie Allergologie

Hôpital Necker - Enfants Malades – Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) – Université Paris V - Paris Descartes

149 rue de Sèvres 75015 Paris

France

16:	Département de pédiatrie

CHU Grenoble – Hôpital Michallon

La Tronche

France

17:	Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble

INSERM : U823 – CHU Grenoble – EFS – Université Joseph Fourier - Grenoble I

Institut Albert Bonniot, BP170, 38042 Grenoble Cedex 9

France

18:	Service de Pneumo-Allergologie

AP-HM – Hôpital Sainte-Marguerite

80, rue Brochier 13 354 Marseille cedex 5

France

19:	CESP - Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations

INSERM : U1018 – Université Paris XI - Paris Sud – Hôpital Paul Brousse – Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)

16 avenue Paul Vaillant Couturier 94807 Villejuif Cedex, France

France

20:	CNG - Centre National de Génotypage

CEA : DSV/IG

2 rue Gaston Crémieux CP5721 91057 EVRY Cedex

France

Abstract:

A genome-wide scan for asthma phenotypes was conducted in the whole sample of 295 EGEA families selected through at least one asthmatic subject. In addition to asthma, seven phenotypes involved in the main asthma physiopathological pathways were considered: SPT (positive skin prick test response to at least one of 11 allergens), SPTQ score being the number of positive skin test responses to 11 allergens, Phadiatop (positive specific IgE response to a mixture of allergens), total IgE levels, eosinophils, bronchial responsiveness (BR) to methacholine challenge and %predicted FEV(1). Four regions showed evidence for linkage (P

Fulltext language:

English

UPMC Pole:

Pôle 4 vie et sante

Project(s), collaboration(s):

E Bouzigon , MH Dizier , C Krähenbühl , Lemainque A , Annesi-Maesano I , C Betard , Bousquet J , Charpin D , F Gormand , Guilloud-Bataille M , Just J , Le Moual N , Maccario J , R Matran , Neukirch F , MP Oryszczyn , E Paty , je Pin , M-Bourgin Rosenberg , Vervloet D , Kauffmann F , Lathrop M , F Demenais .

Publication type:

Article in peer-reviewed journal

DOI:

10.1093/hmg/ddh340

Journal:

Human Molecular Genetics (Hum Mol Genet)
Publisher	Oxford University Press (OUP): Policy B - Oxford Open Option B
ISSN	0964-6906 (eISSN : 1460-2083)

Audience:

international

Publication date:

2004-12-15

Submission date:

2004-10-27

Volume:

Issue:

Page, identifiant, ...:

3103-13

MeSH Classification:

Adolescent – Asthma – Child – France – Genetic Linkage – Genetic Markers – Genome – Human – Humans – Lod Score – Microsatellite Repeats – Phenotype – Smoking


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oai:hal.upmc.fr:hal-00595818
From: Isabella Annesi-Maesano <>
Submitted on: Wednesday, 25 May 2011 16:03:59
Updated on: Wednesday, 25 May 2011 16:03:59