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GPSy: a cross-species gene prioritization system for conserved biological processes--application in male gamete development.
Britto R., Sallou O., Collin O., Michaux G., Primig M., Chalmel F.
Nucleic Acids Research (2012) epub ahead of print - http://www.hal.inserm.fr/inserm-00696905
 (22570409) 
GPSy: a cross-species gene prioritization system for conserved biological processes--application in male gamete development.
Ramona Britto1, Olivier Sallou2, 3, Olivier Collin2, 3, Grégoire Michaux4, Michael Primig1, Frédéric Chalmel () 1
1 :  Irset - Institut de recherche, santé, environnement et travail
http://www.irset.org
INSERM : U1085 – Université de Rennes 1 – École Nationale de la Santé Publique – Université des Antilles et de la Guyane – Biosit
263 avenue Général Leclerc 35042 Rennes Cedex
France
2 :  Plateforme bioinformatique GenOuest
Biogenouest – Université de Rennes 1
France
3 :  INRIA - IRISA - SED
INRIA – CNRS : UMR6074 – Université de Rennes 1
Campus de Beaulieu 35042 Rennes cedex
France
4 :  IGDR - Institut de Génétique et Développement de Rennes
http://igdr.univ-rennes1.fr/
Université de Rennes 1 – CNRS : UMR6290 – Biosit
Faculté de Médecine - CS 34317 2 Av du Professeur Léon Bernard 35043 Rennes Cedex
France
We present gene prioritization system (GPSy), a cross-species gene prioritization system that facilitates the arduous but critical task of prioritizing genes for follow-up functional analyses. GPSy's modular design with regard to species, data sets and scoring strategies enables users to formulate queries in a highly flexible manner. Currently, the system encompasses 20 topics related to conserved biological processes including male gamete development discussed in this article. The web server-based tool is freely available at http://gpsy.genouest.org.
Sciences du Vivant/Bio-Informatique, Biostatistique
Informatique/Bio-informatique
Sciences du Vivant/Biologie du développement
Sciences du Vivant/Biologie de la reproduction
Anglais
0305-1048

Articles dans des revues avec comité de lecture
10.1093/nar/gks380
Nucleic Acids Research (Nucleic Acids Res)
Publisher Oxford University Press (OUP): Policy C - Option B
ISSN 0305-1048 (eISSN : 1362-4962)
internationale
08/05/2012
08/05/2012
epub ahead of print

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