Validation of an appropriate reference gene for normalization of reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction data from rectal cancer biopsies. - Inserm - Institut national de la santé et de la recherche médicale Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Analytical Biochemistry Année : 2009

Validation of an appropriate reference gene for normalization of reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction data from rectal cancer biopsies.

Résumé

Gene expression quantification using reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) requires data normalization using an invariable reference gene. Here we assessed the stability of 15 housekeeping genes in 31 tumor and normal rectal samples to validate a reliable reference gene for rectal cancer studies. Our data show that 18S and 28S RNA are stably expressed in all samples. Moreover, when used for normalization, 18S, but not 28S, greatly reduced unspecific variations of gene expression due to RNA degradation. These results demonstrate that 18S is an appropriate reference gene for normalization of RT-qPCR data from rectal cancer samples.
Fichier principal
Vignette du fichier
Supplementary_Tables.pdf (69.25 Ko) Télécharger le fichier
Figures_11_21.pdf (709.72 Ko) Télécharger le fichier
Revised_manuscript_Anal_Biochem_.pdf (80.72 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

inserm-00396213 , version 1 (19-06-2009)

Identifiants

Citer

Alexandre Ho-Pun-Cheung, Caroline Bascoul-Mollevi, Eric Assénat, Frédéric Bibeau, Florence Boissière-Michot, et al.. Validation of an appropriate reference gene for normalization of reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction data from rectal cancer biopsies.: Normalization of RT-qPCR data in rectal cancer. Analytical Biochemistry, 2009, 388 (2), pp.348-50. ⟨10.1016/j.ab.2009.03.001⟩. ⟨inserm-00396213⟩
203 Consultations
880 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More